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Text File  |  1995-03-04  |  1.7 KB  |  36 lines
  1. *********************************
  2. * Phosphofructokinase signature *
  3. *********************************
  4.  
  5. Phosphofructokinase (EC 2.7.1.11)  (PFK) [1,2] is  a key  regulatory enzyme in
  6. the glycolytic pathway.  It  catalyzes  the phosphorylation by ATP of fructose
  7. 6-phosphate  to fructose  1,6-bisphosphate.  In  bacteria PFK is a tetramer of
  8. identical 36 Kd subunits. In mammals it is a tetramer of 80 Kd subunits.  Each
  9. 80 Kd subunit  consist of two  homologous domains  which are highly related to
  10. the bacterial 36 Kd subunits. In Human there are three, tissue-specific, types
  11. of PFK isozymes: PFKM (muscle),  PFKL (liver),  and PFKP (platelet).  In yeast
  12. PFK is an octamer composed  of  four 100 Kd alpha chains (gene PFK1)  and four
  13. 100 Kd beta chains (gene PFK2);  like the  mammalian 80 Kd subunits, the yeast
  14. 100 Kd subunits are composed of two homologous domains.
  15.  
  16. As a signature pattern for PFK  we selected a region that contains three basic
  17. residues involved in fructose-6-phosphate binding.
  18.  
  19. -Consensus pattern: [RK]-x(4)-G-H-x-Q-[QR]-G-G-x(5)-D-R
  20.                     [The R/K, the H and the Q/R are involved in fructose-6-P
  21.                      binding]
  22. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  23. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  24.  
  25. -Note: Escherichia coli has two phosphofructokinase isozymes which are encoded
  26.  by genes pfkA (major) and pfkB (minor).  The pfkB isozyme is not evolutionary
  27.  related to other prokaryotic or eukaryotic PFK's (see the relevant section).
  28.  
  29. -Last update: December 1991 / Text revised.
  30.  
  31. [ 1] Poorman R.A., Randolph A., Kemp R.G., Heinrikson R.L.
  32.      Nature 309:467-469(1984).
  33. [ 2] Heinisch J., Ritzel R.G., von Borstel R.C., Aguilera A., Rodicio R.,
  34.      Zimmermann F.K.
  35.      Gene 78:309-321(1989).
  36.